Khairul Imam, S.Th.I, M.Ag, lahir di Yogyakarta. Memulai pengembaraan keilmuan di Pondok Pesantren Raudlatul Uqul Sidayu Gresik di bawah asuhan Kyai Ikhwan Hadi dan bersekolah di Madrasah Ibtidaiyah Islamiyah (MII) Sidayu Gresik. Setelah mengkhatamkan al-Quran, ia melanjutkan mengaji dan menghafal al-Quran kepada KH. Maftuh Said di Pondok Pesantren Al-Munawwariyah Sudimoro Bululawang Malang. Sempat menyetorkan hafalan al-Quran kepada KH. Najib Abdul Qadir di Krapyak Yogyakarta dan Ibu Nyai Umi Hani di Pesantren Taruna Al-Quran Yogyakarta.
Memasuki pendidikan menengah, Pak Khairul mengaji al-Quran di bawah bimbingan KH. Hasan Abdullah Sahal dan Kyai Nur Iman di Pondok Pesantren Al-Muqoddasah Nglumpang Mlarak Ponorogo. Kemudian melanjutkan pendidikan formalnya di Pondok Modern Darussalam Gontor Ponorogo. Setamat dari Gontor ia mendapatkan tugas dari masyayikh Gontor untuk mengabdi di Pondok Pesantren Yanbu’ul Qur’an Kudus. Bersamaan dengan itu, ia mengaji sorogan dan bandongan di beberapa pesantren di Kudus dan mengambil sanad al-Quran dari Sayyid Abdul Qadir Umar Basyir di Pesantren Darul Furqon Janggalan Kudus.
Pak Khairul melanjutkan kuliah di Jurusan Tafsir Hadis Fakultas Ushuluddin Universitas Islam Negeri (UIN) Sunan Kalijaga Yogyakarta dan selesai pada tahun 2008. Sebagai pecinta ilmu, Pak Khairul kuliah sambil nyantri di beberapa pesantren, seperti Komplek Mahasiswa Pesantren Sunan Pandanaran Yogyakarta di bawah asuhan KH. Ahmad Zahid dan KH. Imadudin Sukamto, dan Pesantren Lingkar Studi al-Quran (LSQ) Ar-Rahmah Botokenceng Yogyakarta di bawah asuhan KH. Abdul Mustaqim.
Selama kuliah, Pak Khairul juga aktif mengajar di beberapa lembaga pendidikan dan aktif dalam dunia dakwah dan kesenian. Ia aktif sebagai seniman muslim di Sanggar Suto bersama para alumni Krapyak sebagai aktor dan sutradara. Aktif dalam dunia literasi dan perbukuan sebagai editor dan penerjemah buku berbahasa Arab dan Inggris di beberapa penerbit di Yogyakarta dan Jakarta.
Pada tahun 2009, ia melanjutkan kuliah S2 di Program Studi Akidah dan Filsafat Islam di Jurusan Akidah dan Filsafat UIN Sunan Kalijaga Yogyakarta. Selama kuliah S2, ia banyak menimba ilmu dari beberapa pakar tafsir di Yogyakarta, dan berhasil mengkhatamkan beberapa kitab tafsir, ulumul quran, dan hadis. Ia juga aktif dalam berbagai kegiatan penelitian ilmiah dalam ruang lingkup ilmu-ilmu sosial keagamaan, dan aktif mengisi kajian keislaman sebagai penceramah, khatib, dan majelis-majelis semaan al-Quran.
Lulus Program Magister Filsafat Islam UIN Sunan Kalijaga Yogyakarta, Pak Khairul diterima sebagai dosen tetap Prodi Ilmu Hadis Fakultas Ushuluddin Institut Ilmu al-Quran (IIQ) An Nur Yogyakarta. Sembari menjalani aktivitasnya sebagai dosen, atas restu ibunda Hj. Warifah dan dukungan pamannya, KH. Abdullah Effendi ia mendirikan Pondok Pesantren Tahfidz al-Quran (PPTQ) Ibnu Sina Yogyakarta.